안녕하세요 백정복입니다.
님께서 바꾸고자 하는 컬러 설정은 css 파일을 수정하시면 됩니다.
오른쪽에 뜨는 메뉴가 2차메뉴입니다. css 파일에서 2차 메뉴부분을 다음과 같이 바꾸시면 됩니다.

#lnb li a {
    padding:6px 5px 6px 13px;  display:block;
    background:none; color:#ffb401; border-bottom:1px solid #cbcbbe;
    position:relative;  z-index:99; text-align:left; text-decoration:none;
    }
#lnb li a:hover,
#lnb li a:focus { font-weight:bold; color:#ffffff; background:#ff9601; border-bottom:1px solid #cbcbbe; }
#lnb li.on a { font-weight:bold; color:#ffffff; background:#ff9601; border-bottom:1px solid #cbcbbe; }

위의 background부분이 컬러를 설정하는 부분입니다.

달력과 카운터는 제로보드XE가 기본으로 제공하는 위젯입니다.
위젯에 대해서 잘 모르신다면 제로보드 사이트에서 위젯에 관하여 읽어보시길 권장드립니다.
위젯을 추가하는 방법은 layout.html을 보시면 위젯코드를 넣는 부분이 있습니다.
이 부분에 카운터위젯과 달력위젯의 코드를 넣으시면 되겠습니다.

중앙 하단의 카피라이트 부분을 수정하시고자 한다면 layout.html 파일을 열어 105번 라인을 수정하시면 됩니다.
<a href="http://www.jungbok.co.kr"  target="_self">@2007 Jungbok Style</a>
이부분을 원하시는 문구로 바꾸면 되겠습니다.
그럼 스킨 잘 사용하시길 바랍니다.^^